Projet pédagogique pour l’encadrement d’internes en biologie  médicale en phase d’approfondissement 

Le Laboratoire Cerba propose d’accueillir dans son Pôle de Biochimie spécialisée,  Immunologie et Pharmaco-Toxicologie, des internes en DES de Biologie Médicale en  phase d’approfondissement en biochimie spécialisée. 

Le laboratoire Cerba est un laboratoire de biologie médicale spécialisée, de seconde  intention collaborant avec un réseau de laboratoires privés de proximité et d’hôpitaux  généraux répartis sur la métropole, les DOM-TOM et l’international (Europe, Afrique et  Moyen-Orient). Reconnu pour son expertise dans différents domaines de la biologie  spécialisée et récemment labellisé LBMR pour plusieurs disciplines dont la biochimie  spécialisée et l’hormonologie. 

L’accueil, la formation et l’activité de l’interne se feront sur le plateau technique du  Laboratoire Cerba situé au 7/11 rue de l’Equerre à Saint-Ouen l’Aumône, sous la  responsabilité des biologistes médicaux du pôle. 

L’équipe médicale du Laboratoire Cerba est organisée en pôles de biologistes correspondants aux différentes disciplines de la biologie médicale  

Il compte aujourd’hui 4 pôles (microbiologie, hématologie, génétique humaine,  biochimie spécialisée Immunologie & Pharmaco-Toxicologie) 

Le pôle de de Biochimie spécialisée, Immunologie et Pharmaco-Toxicologie est un  pôle multidisciplinaire avec une activité de biochimie spécialisée riche et diversifiée,  combinant compétences médicales et techniques de pointe. 

Ce pôle est composé de 5 biologistes médicaux et d’un Pharmacologue participant  aux développements en Pharmaco-Toxicologie.

CERBA – 95066 CERGY PONTOISE CEDEX 9 – FRANCE 

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CERBA SELAFA AU CAPITAL DE 960.000 € – RCS PONTOISE D 402 928 766 – ENREGISTREMENT N° 95.9 

L’équipe non médicale du laboratoire est organisée en un service pré-analytique et 9 unités techniques (UT) : 

• Le service pré-analytique (SPRA) : responsable de l’enregistrement des  dossiers, de la vérification de la conformité et du traitement pré-analytique des  échantillons 
• UT Semi-spécialités : où sont réalisés la plus grande partie des examens de  biochimie sur des chaines analytiques, des automates ELISA et en RIA  • UT Immunologie 
• UT Physico-chimie où sont réalisées les techniques de chromatographie (avec  détection UV, mass), l’ICP-MS, etc 
• UT Biologie Moléculaire Infectieuse 
• UT Microbiologie 
• UT Cytométrie en flux 
• UT Biologie moléculaire génomique  
• UT Cytogénétique constitutionnelle 
• UT Cytogénétique hémato-Fish  

Chaque unité technique est dirigée par un ou plusieurs Responsables d’unité  technique (RUT) équivalents de cadre, en charge du management des techniciens et  du bon déroulement des examens réalisés dans leurs UT. 

Le laboratoire comprend un service d’Assurance Qualité qui s’assure de l’application  des exigences de la norme 15189 dans les différents processus du laboratoire, assure la gestion documentaire, l’organisation des audits internes et des audits Cofrac ainsi  que le suivi des indicateurs Qualité. 

L’équipe de l’assurance Qualité travaille en étroite collaboration avec les biologistes  médicaux et l’équipe technique pour la vérification et la validation des méthodes  analytiques employées au laboratoire. 

Le laboratoire Cerba est aujourd’hui accrédité pour 86% de ses examens selon la  norme 15189.

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Description des différentes activités de biochimie au sein du pôle  

Les biologistes médicaux du pôle présentent des expertises dans les différents  domaines de la biochimie spécialisée, l’Immunologie et la Pharmaco-Toxicologie 

La demande étant portée sur la biochimie, seule cette discipline sera détaillée : 

– Activité de biochimie hormonale :  

Le laboratoire contribue à l’exploration de l’axe hypothalamo-hypophysaire et  réalise les analyses liées aux axes gonadotrope, thyréotrope, somatotrope et  lactotrope, activité pour laquelle le laboratoire vient d’être labellisé Laboratoire  national de référence. 

La quasi-totalité des analyses permettant ces explorations hormonales est  disponible (dosages unitaires, tests dynamiques). Les méthodes utilisées sont  diverses (RIA, spectrométrie de masse, chimiluminescence, électrophorèse,  etc..) et font appel à un panel d’automates important et varié. 

– Activité d’exploration des protéines :  

Sont réalisés l’ensemble des examens nécessaires au diagnostic et au suivi  des gammapathies monoclonales : électrophorèses des protéines sériques,  urinaires, immunofixations, recherche de protéinurie de Bence Jones, dosage  des chaînes légères libres sériques et urinaires. 

Dans ce même secteur sont réalisés les isoélectrofocalisations LCR/Sérum  pour la recherche de bandes oligoclonales d’IgG, la recherche et l’identification  de cryoglobulines ainsi que différents profils protéiques (immunitaires,  inflammatoires, nutritionnels, etc) 

Les biologistes et les techniciens du secteur ont acquis une grande expérience dans l’interprétation des dossiers de par le recrutement très large tant quantitatif  que qualitatif car certains laboratoires de proximité sous-traitent les cas les plus  complexes, ce qui permet de voir de nombreux cas de figure différents, y  compris rares (myélomes à IgD, à IgE, à chaînes légères, cryoglobulines  monoclonales, etc) et d’appréhender les pièges possibles dans l’interprétation. Ces examens sont réalisés à l’aide de méthodes sensibles et spécifiques telles  que l’électrophorèse capillaire, l’immunofixation sur gel d’agarose. 

– Activité de biochimie des cancers : 

Sont réalisés au laboratoire l’ensemble des marqueurs biochimiques tumoraux  les plus fréquents (SCC, Chromogranine A, score ROMA), mais également des  marqueurs nécessitant notamment des techniques particulières (Radio-

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Immunologie, LCMSMS). Le laboratoire réalise ainsi des dosages de PTHrp, de  Vasoactive Intestinal Peptide, de sérotonine, de 5HIAA (acide 5 hydoxy indol  acétique) par exemple, qui permettent de se familiariser avec ces techniques  spécialisées et leurs pièges. 

– Marqueurs de fibrose hépatique : 

Ils permettent l’évaluation non invasive de la fibrose et/ou de l’activité  inflammatoire du foie via le dosage de plusieurs paramètres et le calcul de  scores à l’aide d’algorithmes validés. 

– Biochimie métabolique : 

Le laboratoire permet à un large réseau d’hôpitaux généraux et de cliniques non  rattachées à des Centre Hospitalo-Universitaires de réaliser le diagnostic et le  suivi des erreurs innées de métabolisme, telles que les désordres  peroxysomaux, des acidaminopathies et des aciduries organiques et des  maladies de surcharge lysosomale par le dosage de l’activité enzymatique sur  culot leucocytaire et papier buvard. Grâce à son expertise et les équipements  de pointe de son plateau technique, le laboratoire réalise quotidiennement un  panel varié de techniques de séparation chromatographique avec différente  méthodes de détection (LC-MSMS, UPLC-MS, GC-MS) dans différents milieux  biologiques. La démarche de diagnostic biochimique est complétée, pour un  grand nombre de pathologies, par une confirmation par biologie moléculaire  visant à identifier la mutation causale.  

– Diagnostic des maladies neurodégénératives : 

Dans le domaine du diagnostic des maladies neurodégénératives, le laboratoire  Cerba propose la recherche génétique de prédisposition à la maladie  d’Alzheimer par le génotypage de l’Apolipoprotéine E ainsi que sa confirmation  sur le plan biologique par le dosage des biomarqueurs (peptide amyloïdes Beta 

42, la protéine TAU totale et sa forme phosphorylé) dans le liquide  céphalorachidien. 

– Typages morpho-constitutionnels des lithiases et coprologie  fonctionnelle :  

Le laboratoire Cerba est l’un des rares laboratoires français réalisant des  analyses de typage morpho-constitutionnel des lithiases urinaires par des  techniques de pointe de spectrométrie infra-rouge et de biologie appliquée à la 

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gastro-entérologie : bilan multiparamétrique, microscopie et biochimie, dans le  cadre de la coprologie fonctionnelle complétée par un éventail de marqueurs  fécaux d’entéropathie exsudative, des maladies inflammatoires chroniques de  l’intestin (MICI), de la perméabilité intestinale, de l’activité exocrine du  pancréas.  

– Nutrition/ vitamines et oligoéléments :  

Le laboratoire effectue les dosages de la plupart des vitamines et oligoéléments  dans le cadre du dépistage des carences, ainsi que dans le suivi thérapeutique  de patients atteints de pathologies génétique, métabolique, digestive,  dermatologique etc. Il effectue également ces dosages dans le cadre du suivi  nutritionnel du sportif de haut niveau, et dans l’exploration du stress oxydatif.  Les méthodes utilisées sont essentiellement chromatographiques et  spectrométriques (HPLC, SAA, ICP-MS, LC-MS…) 

– Activité de pharmaco-toxicologie : 

L’activité sur le secteur de pharmacologie/toxicologie consiste en la  détermination des concentrations dans différents liquides biologiques de  nombreuses molécules pharmacologiques, dont les immunosuppresseurs, les  neuroleptiques, antidépresseurs, anxiolytiques, antiépileptiques, antibiotiques  et antiarythmiques ainsi qu’une activité importante de phénotypage de la DPD  selon les recommandations HAS/ANSM par le biais du dosage de l’uracile et  de son métabolite. 

Engagement important du laboratoire dans le domaine de la toxicologie, aussi  bien des dépistages et dosages des différents stupéfiants et des marqueurs de  l’imprégnation alcoolique, que de la biométrologie avec l’exposition  professionnelle ou non à différents toxiques (solvants ou métaux  principalement). 

Les techniques analytiques utilisées sont aussi diverses que les analyses  proposées, à savoir des techniques de chromatographie liquide ou gazeuse,  couplées à différents détecteurs (UV, masse), l’ICP-MS, ou encore des  techniques d’immunochimie, d’enzymologie, d’électrophorèse capillaire ou de  néphélémétrie.

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Description de la formation de l’interne et de ses objectifs de stage 

Les objectifs du stage seront définis après un entretien préalable avec l’étudiant et  le coordonnateur de spécialité, en fonction des besoins de formation et du choix de  parcours souhaité par l’étudiant 

L’interne suivra un parcours de formation habilitation à la validation biologique en  biochimie, selon les modalités prédéfinies par les biologistes du pôle. Cela inclut,  la découverte de la gamme d’analyses réalisées dans la spécialité, une formation  à l’interprétation des dossiers patients, à la gestion des contrôles internes et  externes de Qualité et à la prestation de conseil. 

L’interne sera également invité à prendre connaissance des procédures générales  et techniques en lien avec son activité, disponibles sur le logiciel de gestion  documentaire du laboratoire. 

Tout au long du stage, il aura la possibilité de découvrir le plateau technique et de  suivre les techniciens pour appréhender de nouvelles techniques diagnostiques  qu’il n’aurait pas eu l’opportunité de découvrir durant ces précédents semestres. Il  suivra également les biologistes du pôle dans leurs différentes activités : validation  biologique, discussions clinico-biologiques, prestation de conseil, revue de  prescription, vérification et validation de méthodes, formation et accompagnement  des techniciens, etc. A l’issue de cette période, l’habilitation de l’interne sera  formalisée à l’aide des grilles d’habilitation complétées et visées par les biologistes  responsables de son encadrement. Il pourra alors participer aux différentes  activités du pôle sous la responsabilité d’un biologiste titulaire. 

Devant la diversité des activités proposées dans la spécialité, un grand nombre de  sujets de mémoire seront proposées à l’interne. Des sujets allant du  développement de nouvelles méthodes analytiques à l’étude de cohortes de  patients. Le choix sera fait en concertation avec l’interne, en fonction de son  appétence et de ses souhaits d’orientation.

Mise à jour le 16/11/2021 par Killian