Hôpital

• Type : CHU
• Adresse : 51 boulevard du Maréchal de Lattre de Tassigny. 94000 Créteil
• Nombre de lits : 3106 dont 1081 de MCO
• Spécialités : Chirurgie cardiaque (dont greffe cardiaque et filière endocardite), chirurgie plastique – réparatrice (dont filière fasciite nécrosante), chirurgie viscérale dont greffe hépatique), chirurgie urologique (dont greffe rénale), neurochirurgie, chirurgie orthopédique, réanimation médicale / chirurgicale / cardiaque, immunologie et maladies infectieuses, médecine interne, néphrologie, hématologie clinique dont greffe de moelle osseuse, hépatogastroentérologie (Helicobacter pylori, greffe hépatique), dermatologie (dont centre de référence Lyell), maladies du globule rouge (filière drépanocytaires) . Le CHU Henri Mondor a par ailleurs obtenu la labellisation d’un Département Hospitalo- Universitaire (DHU) dans le domaine de l’infectiologie (DHU Virus Immunité Cancers – VIC). Présence d’une équipe mobile d’infectiologie (1 PH, 1 CCA et 1 interne) localisée dans le laboratoire.
• Moyens d’accès/transport : Métro ligne 8, arrêt Créteil L’Echat Bus

Laboratoire

Chef de service : Jean-Michel PAWLOTSKY jean-michel.pawlotsky@aphp.fr

Responsable des internes : Jean-Winoc DECOUSSER (Bactériologie) jean-winoc.decousser@aphp.fr Stéphane CHEVALIEZ (Virologie) stephane.chevaliez@aphp.fr

Effectifs : PU-PH : 2 MCU-PH : 4 AHU : 1 PH : 4 PA : 3  Internes : 3 Externes : 1 Techniciens : 30

Staff :

• Réunions de services : 3/semaine
• Réunions clinico-biologiques : 4/semaine (infectiologie/endocardite /chirurgie orthopédique/ réanimation chirurgicale cardiaque)
• Réunions bibliographiques : 1/mois
• Réunion de recherche (Unité INSERM U955, Eq18) : 1/semaine

Cours organisé par le service :

Agrément : Niveau 1 et 2 / socle et spécialisation bactériologie virologie

Techniques utilisées, spécialités :

Intégration de l’interne dans la démarche qualité et d’accréditation :

Gardes :  NON

• Pool de garde :
• Fréquence :
• Horaires :
• Personnel de garde :
• Activité(s) :

Astreintes

• Jour(s) : 1 à 2 après-midi/semaine, 1 samedi/mois
• Horaires : 14h – 18h en semaine, 9h30-13h le samedi
• Activité(s) : validation biologique des examens directs, des hémocultures positives et autres prélèvements urgents en particulier en virologie (AES et grossesses non suivies).

Missions/ Activités principales de l’interne

L’unité de bactériologie – hygiène dispose de l’ensemble des méthodes de détection directe et indirecte des agents infectieux : plateforme de culture et d’identification phénotypique (MALDI-TOF, identification biochimique), plateforme de détection et d’identification génotypique (plateforme de biologie moléculaire, NGS), plateforme de sérologie. Une place importante est consacrée à la gestion des tests rapides de détection incluant les approches syndromiques, en liaison directe avec les infectiologues et les référents antibiotiques des services. La déclinaison de ces moyens au niveau des différents temps de la bactériologie (J0, J1…) est formalisée et inclus dans la formation des internes. La validation de ces différents temps microbiologiques est assurée par des seniors en bactériologue présents 7j/7. L’interne est formé et participe à la validation biologique, en liaison directe avec l’équipe mobile d’infectiologie et les cliniciens de façon individuelle et dans le cadre des réunions pluridisciplinaires :
– Mercredi de 14h30 à 15h30 : réunion pluridisciplinaire d’infectiologie (présentation des cas complexes de l’ensemble de l’hôpital par les cliniciens responsables de chaque patient des services concernés)
– Mercredi de 14h30 à 15h30 : réunion pluridisciplinaire de la filière endocardite (chirurgien cardiaques/ cardiologues / infectiologues / microbiologistes)
– Jeudi de 16h à 17h : réunion pluridisciplinaire de chirurgie orthopédique (chirurgien / infectiologues / microbiologistes)
– Vendredi de 15h30 – 16h30 : réunion pluridisciplinaire en réanimation chirurgicale cardiaque (réanimateurs / infectiologues / microbiologistes). Les internes de bacétriologie – virologie effectuent une partie de leur stage ( 2 à 4 semaines) dans l’équipe mobile d’infectiologie. Un carnet d’habilitation (« parcours de formation ») est fourni à chaque interne. Par ailleurs
chaque interne doit consulter et valider un certain nombre de documents sur le logiciel de gestion documentaire Kalilab®. L’unite de Virologie est organisée en 4 secteurs : le secteur des hépatites virales, les secteurs des infections virales des immunodéprimés (ID), le laboratoire central des urgences virologiques et des qualifications des donneurs d’organes, de tissus et de cellules de l’AP-HP et le secteur des rétrovirus. L’unité de Virologie abrite également le Centre National de Référence (CNR) des hépatites virales B, C et D. Le laboratoire réalise le diagnostic et le suivi des infections virales des malades hospitalisés, des consultants et des patients inclus dans les protocoles thérapeutiques en particulier pour les patients infectés pour le VHC et coinfectés VIH-VHC. Le CNR des hépatites B, C et D assure les missions à l’échelon national de la surveillance de l’épidémiologie des hépatites virales et de la résistance de ces virus aux antiviraux, en partenariat avec Santé publique France (SpF). Les domaines d’expertise du CNR se répartissent en 3 axes qui couvrent largement les champs de la virologie des hépatites, de l’investigation technologique à la recherche clinique et translationnelle. Ces axes sont les suivants : expertise technologique, épidémiologie moléculaire, recherche clinique et translationnelle centrée sur la variabilité génétique naturelle et associée la chimiothérapie antivirale du VHB et VHC. Le laboratoire hospitalier de virologie est adossé à l’Unité INSERM U955, équipe 18, au sein de l’Institut Mondor de Recherches Biomédicales (IMRB). L’équipe INSERM mène une recherche translationnelle dans les domaines suivants : développement de nouvelles approches thérapeutiques et l’étude des mécanismes moléculaires de la résistance aux antiviraux d’une part, et d’autre part l’hépatocarcinogenèse viro-induite, les mécanismes de la croissance tumorale et le rôle du micro-environnement hépatique.

Missions/Activités ponctuelles et projets de recherche

Les internes participent à la mise en place de nouvelles approches diagnostiques (PCR syndromiques, test rapides d’identification et antibiogramme…), au processus d’accréditation du laboratoire. Par ailleurs des sujets de thèse et des travaux sont proposés (7 thèses ces 5 dernières années). Ces travaux sont régulièrement présentés à des congrès nationaux (RICAI, Journée Francophones de Virologie, etc…) et donnent naissance à des articles publiés dans des revues internationales à comité de lecture.

Liste des principales publications impliquant des travaux confiés aux internes :
Stenotrophomonas maltophilia healthcare-associated infections: identification of two main pathogenic genetic backgrounds. Corlouer C, Lamy B, Desroches M, Ramos-Vivas J, Mehiri- Zghal E, Lemenand O, Delarbre JM, Decousser JW; Collège de Bactériologie-Virologie-Hygiène des Hôpitaux de France. J Hosp Infect 2017;96(2):183-188.

The contribution and limits of clinical specimens for the screening of intestinal multidrug- resistant bacteria in view of laboratory automation GERAUD DE GALASSUS Alix, CIZEAU Florence, AGATHINE Aurélie, DOMRANE Cecilia, DUCELLIER David, FIHMAN Vincent, DECOUSSER Jean-Winoc . J Hosp Infect. 2017 in Press.

Acquisition of Broad-Spectrum Cephalosporin Resistance Leading to Colistin Resistance in Klebsiella pneumoniae. Jayol A, Nordmann P, Desroches M, Decousser JW, Poirel L. Antimicrob Agents Chemother 2016;60(5):3199-201.

Distribution and antimicrobial susceptibility of bacteria from adults with community- acquired pneumonia or complicated skin and soft tissue infections in France: the nationwide French PREMIUM study. Leprince C, Desroches M, Emirian A, Coutureau C, Anais L, Fihman V, Soussy CJ, Decousser JW; PREMIUM study group. Diagn Microbiol Infect Dis 2015;83(2):175- 82.

Laboratory-based strategy using a new marketed polymerase chain reaction assay to manage diarrheic episodes among patients from rehabilitation and long-term care facilities. Salmona M, Jolivet S, Duprilot M, Akpabie AC, Fourati S, Decousser JW. Am J Infect Control 2016;44(6):716-8.

New procedure to reduce the time and cost of broncho-pulmonary specimen management using the Previ Isola® automated inoculation system. Nebbad-Lechani B, Emirian A, Maillebuau F, Mahjoub N, Fihman V, Legrand P, Decousser JW. J Microbiol Methods 2013;95(3):384-8.

Performance of a new rapid test for the detection of hepatitis B surface antigen in various patient populations. Chevaliez S, Challine D, Naija H, Luu TC, Laperche S, Nadala L, Allain JP, Lee HH, Pawlotsky JM. J Clin Virol 2014;59(2):89-93.

Characterization of the dynamics of human cytomegalovirus resistance to antiviral drugs by ultra-deep sequencing. Guermouche H, Mercier-Darty M, Burrel S, Kaufman T, Rogier O, Pawlotsky JM, Boutolleau D, Rodriguez C. Article soumis.

Necrotising fasciitis causative microbial agents dioagnostic improvement by shotgun metagenomic. Rodriguez C, Jary A, Hua C, Desroches M, Sitterle E, Gricourt G, Pawlotsky JM, Sbidian E, Decousser JW.

Mise à jour :